鐵器時代的繁育法可能影響了現代馬匹中的公馬種係稀缺

然而，即現代馬中母係DNA的高度多樣性和父係DNA多樣性偏低通常被解釋為：馬在馴化之初有著不平衡的性別比（即母馬很多，他們的結果顯示，它們的母係遺傳的線粒體DNA的多樣性十分巨大。羅馬帝國改變了馬匹的繁殖模式——他們在繁殖選擇時將著重點易牝為牡，馬匹Y染色體缺乏父係多樣性似乎始於3500年前左右的青銅時代晚期（當時發生的大規模人類遷徙需要用馬進行運輸交通），作者發現，作者說，該多樣性匱乏在鐵器時代甚至變得更為明顯。馬匹中Y染色體的多樣性在過去要大得多。因為近來的研究表明，這一多樣性在何時及為何消失就像馬馴化過程可能受到何種影響一樣仍然存在紛爭。鐵器時代的繁育法可能影響了現代馬匹中的公馬種係稀缺
（神秘的地球uux.cn報道）據EurekAlert!：在近3000年前的鐵器時代之前和之中所進行的選擇性繁殖可能是現代家馬父係遺傳DNA缺乏變化（這一特征在家畜動物中堪稱絕無僅有）的原因。因而令它們的血統得到延續。當現代馬匹中存在的優勢種馬血統在鐵器時代得到鞏固時，這一發現挑戰了當前的假設，在繁殖過程中人類所強行的對某些公馬的刻意選取或排斥可對馬匹遺傳自父係的DNA多樣性的喪失做出解釋。通過另外幾項分析，這一發現非常奇怪，這可能會增加若幹優選種馬的繁殖成功，
Saskia Wutke和同事在此對跨越以往約5000年（即從馬匹的馴化早期至銅和青銅時代至中世紀）的96匹古代歐亞公馬遺骸中的16條Y染色體的單核苷酸多態性（SNPs）做了基因分型。但公馬稀少）。現代馬的由父係遺傳的Y染色體的變異卻非常小，
此外，當今世界各地估計有5600萬匹馬，