下麵99單機小編列出全部神獸捕捉地點，
急凍鳥：哈吉左邊道路登瀑布
閃電鳥：流星瀑布最深處的更深處
火焰鳥：冠軍之路第二層
超夢：和石之洞窟某NPC對話（選“否”）得到破壞因子後去到壞天氣岩石洞裏
夢幻：取下超夢身上的古代海圖坐船
水君：山優市瀑布洞
雷公：銀葉發電廠
炎帝：火之捷徑
洛奇亞：抓完3鳥後的116號道路洞口
鳳王：抓完3獸後的116號道路洞口
雪拉比：天元森林衝浪
鋼柱神：和原版一樣
岩柱神：同上 冰柱神：同上
紅水都、裂空座：和原版一樣
基拉祈：超能市白色隕石
代歐奇西斯：拿怪力術的洞窟衝浪
鑽石：通關後看看洞退潮後的冰洞
珍珠：通關後流星瀑布新開洞
鬼龍：通關後日落山大樓頂層白墳墓
美夢神：通關後到賓館2樓得到三日月羽毛,然後在道吉睡覺
噩夢神：在鬼屋中得到暗黑之羽後在阿田睡覺
草刺蝟：孵蛋之道洞窟
創世神：捕捉珍鑽的3神後,覺醒寺最底部
白：通關後火山山頂洞口
黑：通關後石之洞窟中的洞口
灰：通關後雪鎮右側道路洞口
做主線任務的路途上絕大多數都能遇到，口袋妖怪漆黑的魅影神獸大全 口袋妖怪神獸捕捉地點。藍水都：1個和原版一樣,另一個與阿田市水手對話得船票,坐船
固拉多、蓋歐卡、然而還是會有一些一不小心就漏掉了，這樣就不用擔心了。
